বিজ্ঞানীরা সম্প্রতি একটি নতুন ওপেন-সোর্স কৃত্রিম বুদ্ধিমত্তা (AI) মডেলের ‘স্নিক প্রিভিউ’ প্রকাশ করেছেন, যা প্রোটিনের ত্রিমাত্রিক গঠনের পূর্বাভাস দিতে পারে। গবেষকদের মতে, এটি গুগল ডিপমাইন্ডের যুগান্তকারী প্রোটিন-ফোল্ডিং এআই AlphaFold3-এর পারফরম্যান্সের কাছাকাছি পৌঁছেছে।
OpenFold3 নামে এই সিস্টেমটি তৈরি করেছে OpenFold Consortium, যা ক্যালিফোর্নিয়ার ডেভিসে অবস্থিত একটি অলাভজনক প্রতিষ্ঠান, যেখানে একাধিক একাডেমিক ও বেসরকারি গবেষণা প্রতিষ্ঠান একসঙ্গে কাজ করছে। OpenFold3 প্রোটিনের অ্যামিনো অ্যাসিড সিকোয়েন্স ব্যবহার করে তাদের ত্রিমাত্রিক (3D) গঠন নির্ধারণ করে এবং ওষুধ বা ডিএনএর মতো অন্যান্য অণুর সঙ্গে কীভাবে প্রতিক্রিয়া করে তা মডেল করতে পারে।
যদিও এটি এখনো AlphaFold3-এর সব ফিচার ধারণ করেনি, তবুও “আমরা যত দ্রুত সম্ভব গবেষকদের হাতে কিছু তুলে দিতে চেয়েছিলাম,” বলেন উডি শারম্যান, যিনি কনসোর্টিয়ামের এক্সিকিউটিভ কমিটির চেয়ার এবং বোস্টনের Psivant Therapeutics-এর চিফ ইনোভেশন অফিসার। গবেষকদের কাছ থেকে প্রাথমিক প্রতিক্রিয়া পাওয়ার পর মডেলটি আরও উন্নত করার পরিকল্পনা রয়েছে তাদের।
পূর্ণ সংস্করণ আসছে শিগগিরই
OpenFold3 প্রশিক্ষিত হয়েছে ৩ লক্ষেরও বেশি মলিকুলার স্ট্রাকচার এবং ৪ কোটি কৃত্রিম গঠনের ডাটাবেস দিয়ে। এখন পর্যন্ত এর উন্নয়নে প্রায় ১.৭ কোটি মার্কিন ডলার ব্যয় হয়েছে।
AlphaFold3 যেখানে সীমিত একাডেমিক ব্যবহারের জন্য উন্মুক্ত, সেখানে OpenFold3 একাডেমিক গবেষক থেকে শুরু করে ওষুধ কোম্পানি, যে কেউ ব্যবহার করতে পারবে। “এটি কাঠামোগত জীববিজ্ঞানে এআই ব্যবহারের গণতন্ত্রীকরণের দিকে বড় পদক্ষেপ,” বলেন শারম্যান।
এই প্রিভিউ রিলিজের মাধ্যমে গবেষকরা OpenFold3-এর কোড ব্যবহার ও পরীক্ষা করতে পারবেন। শারম্যান জানান, পূর্ণাঙ্গ সংস্করণের জন্য কিছু টেকনিক্যাল উন্নয়নের কাজ এখনো চলছে এবং কয়েক মাসের মধ্যেই সম্পূর্ণ সংস্করণ প্রকাশের পরিকল্পনা রয়েছে। “আমরা খুব কাছাকাছি পৌঁছে গেছি,” তিনি বলেন, “আরও সামান্য প্রচেষ্টায় আমরা সম্পূর্ণ সমতা অর্জন করব।”
ন্যাশভিলের ভ্যান্ডারবিল্ট বিশ্ববিদ্যালয়ের কম্পিউটেশনাল স্ট্রাকচারাল বায়োলজিস্ট স্টেফানি ওয়ানকোভিজ বলেন, “আমি OpenFold3 পরীক্ষা করার জন্য উৎসুক। এটি বর্তমান মডেলগুলোর তুলনায় কেমন পারফর্ম করে, তা দেখতে চাই।”
ওপেন-সোর্স মডেলের উত্থান
OpenFold3 আসলে একটি বৃহত্তর আন্দোলনের অংশ, যেখানে গবেষকেরা AlphaFold3-এর ওপেন-সোর্স বিকল্প তৈরি করছেন। এই প্রচেষ্টা শুরু হয় মে ২০২৪-এ, যখন লন্ডনভিত্তিক Google DeepMind তাদের AlphaFold3 প্রকাশ করলেও কোডটি প্রকাশ করেনি। গবেষকরা এ সিদ্ধান্তের সমালোচনা করেন। পরে, নভেম্বর ২০২৪-এ DeepMind একাডেমিক ব্যবহারের জন্য কোড এবং মডেল ওয়েট উন্মুক্ত করে, তবে তা এখনো বাণিজ্যিক ব্যবহারের জন্য নিষিদ্ধ।
গত বছরের শেষদিকে MIT-এর গবেষক রেজিনা বারজিলেই ও তার সহকর্মীরা Boltz2 নামে একটি ওপেন-অ্যাকসেস মডেল প্রকাশ করেন, যার দ্বিতীয় সংস্করণ ২০২৫ সালের শুরুতে প্রকাশিত হয়। এটি প্রোটিন গঠন পূর্বাভাসের পাশাপাশি ছোট লিগ্যান্ডগুলোর সঙ্গে তাদের সংযোগ শক্তিও নির্ধারণ করতে পারে।
“বায়োমলিকিউলার ইন্টারঅ্যাকশন মডেলিংয়ের জন্য আরও ওপেন-সোর্স টুল আসছে, এটা দারুণ ব্যাপার,” বলেন বারজিলেই। “AlphaFold3 একটি বৈজ্ঞানিক বিপ্লব ছিল, কিন্তু Boltz-1 এর মতো ওপেন মডেল ইতিমধ্যেই গবেষণায় অনেক সুবিধা দিচ্ছে। OpenFold3 গবেষণা সম্প্রদায়ের জন্য আরও একটি শক্তিশালী বিকল্প হবে।”
ওয়ানকোভিজ মনে করেন, AlphaFold3, OpenFold3 এবং Boltz মডেলগুলোর তুলনা করে গবেষকেরা বুঝতে পারবেন “অ্যালগরিদমগুলোর কার্যকর অংশগুলো কীভাবে একে অপরের সঙ্গে সম্পর্কিত এবং কোন অংশটি কোন কাজের জন্য সবচেয়ে গুরুত্বপূর্ণ।”
ইতিমধ্যেই কয়েকটি ফার্মাসিউটিক্যাল ও বায়োটেক কোম্পানি ঘোষণা করেছে যে তারা OpenFold3 ব্যবহার করবে অটোইমিউন রোগ ও সেল থেরাপির ওষুধ ডিজাইনে, এমনকি উদ্ভিদ ও ফসল সুরক্ষাকারী অণু তৈরিতেও।
শারম্যান বলেন, “পূর্ণ রিলিজই কেবল শুরু। আমরা মডেলটি নিয়মিত আপডেট করব এবং আরও বেশি অণু যুক্ত করে ডেটাসেট বাড়াব। আমরা এখন প্রোটিনের বাইন্ডিং অ্যাফিনিটি এবং তাপীয় স্থিতিশীলতা পূর্বাভাসের ওপরও কাজ করছি।”
নিয়মিত আপডেট পেতে সাবস্ক্রাইব করুন আমাদের নিউজলেটারে এবং ফলো করুন আমাদের টেলিগ্রাম, ইনস্টাগ্রাম, টুইটার এবং ফেসবুক-এ। এছাড়াও যুক্ত হতে পারেন আমাদের ফেসবুক গ্রুপে।
এই নিবন্ধটি Creative Commons Attribution-NoDerivatives 4.0 International License-এর অধীনে লাইসেন্সকৃত। পুনঃপ্রকাশের জন্য পুনঃপ্রকাশের নির্দেশিকা দেখুুন।
